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科研动态

精密测量院在核酸适体分子识别与传感机制方面取得新进展

来源:     时间:2026-10-30

核酸适体是一类人工合成、可特异性结合靶标的寡核苷酸片段,在疾病诊疗、生物传感等领域具有广泛的应用前景。团队长期围绕毒素、神经递质等小分子的核酸适体识别与传感机制开展研究,前期已成功解析了赭曲霉毒素A(OTA)核酸适体和黄曲霉毒素 AFB1 核酸适体的高分辨结构,揭示了其分子识别与传感机制,提出了基于结构的精准适体优化策略,并获得了选择性和亲和性更优的核酸适体。

在此基础上,团队在五羟色胺(serotonin)核酸适体的识别机制上取得重要进展。五羟色胺是一种关键神经递质,参与调节多种神经系统功能,实现其高灵敏、高特异的实时检测对神经科学研究和临床诊断至关重要。2018年,Nakatsuka等人报道了一种高亲和(Kd约30 nM)、高特异性识别五羟色胺的44-mer核酸适体Apt44,该适体在五羟色胺检测中表现出极大潜力。然而,由于缺乏实验测定的高分辨结构,其高亲和、高特异性的分子识别机制及传感机制仍不明确。

研究团队利用液体核磁共振技术,解析了五羟色胺核酸适体Apt38(Apt44截短6个核苷酸的变体,其亲和力稍优于Apt44)在游离态和五羟色胺结合态的高分辨溶液结构(如图所示)。结果显示,游离态和结合态的适体均形成由两层反平行G-四链体(G4)、三个侧向环及末端双链组成的G4–双链杂合结构。五羟色胺结合于G4–双链交汇区,直接堆积在G-四分体平面上,但不与双链直接接触,代表了一种新型的G4-双链结合模式。该结合由堆积作用、静电吸引、氢键和疏水相互作用共同稳定。此外,研究发现,在结合五羟色胺前后,Apt44与截短体Apt38的构象变化程度并不相同,Apt38仅发生微小构象变化,而Apt44由于具有更长的loop3环区,其G4骨架具有更高的构象动态,使其在溶液中能够发生结合触发的显著构象转变,这清晰解释了Apt44适体的传感机制。总之,该工作阐明了五羟色胺适体的分子识别与传感机制,为生物传感应用提供了结构基础及理性设计框架。

五羟色胺核酸适体高亲和识别底物的分子机制

该研究以“Recognition Mechanism of Serotonin by a G-Quadruplex‑Duplex Hybrid Aptamer”为题发表在学术期刊《德国应用化学》(Angewandte Chemie International Edition)上,精密测量院研究员徐国华和博士后王晨、中国科学院生态环境研究中心博士康美婷为共同第一作者,中国科学院生态环境研究中心研究员赵强、精密测量院研究员徐国华和李从刚为通讯作者。

该研究工作得到了国家自然科学基金委,科技部和中国科学院的资助。

论文链接:https://doi.org/10.1002/anie.8380078